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mysql ibdata1文件存放数据，索引等。

如果不把数据库中数据分开存放的话，这个文件的大小很容易就上了G，甚至几十G。对于某些应用、磁盘较小的server来说，并不是太合适。因此要把此文件缩小。

方法：数据文件单独存放。

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详见：http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/zh/database-administration.html#backup

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步骤：

1，备份数据库

从命令行进入MySQL Server 5.5/bin
备份全部数据库，执行命令mysqldump -q -uusername -pyourpassword --add-drop-table --all-databases > /all.sql

做完此步后，停止数据库服务。

2，修改mysql配置文件

修改my.ini文件，增加下面配置

iinnodb_file_per_table = 1

对每张表使用单独的innoDB文件, 修改/etc/my.cnf文件

3，删除原数据文件

删除原来的ibdata1文件及日志文件ib_logfile*，删除data目录下的应用数据库文件夹(mysql文件夹不要删)

4，还原数据库

启动数据库服务

从命令行进入MySQL Server 5.5/bin
还原全部数据库，执行命令mysql -uusername -pyourpassword < /all.sql